明治12年、1878年、中央集権体制の元、都市部を管轄する区割りは「区」だった。
後の「市」と違って自治権は小さかった。
その領域はとても狭く、そのほとんどが江戸時代以来の人口密集地域に限られていた。
その後これらの街は、隣接していた村を吸収して巨大化していった。
当時の村は、小学校名として残っていることが多く、おおよその場所がわかる。
三都には、複数の区が設置された。
| 都市 | 区名 | 現在 | 隣接町村1889 |
| 東京 | 麹町 神田 | 千代田 | |
| 日本橋 京橋 | 中央 | ||
| 芝 麻布 赤坂 | 港 | 品川町・大崎・渋谷・目黒・千駄ヶ谷 | |
| 四谷 牛込 | 新宿区一部 | 千駄ヶ谷・内藤新宿町・大久保・戸塚 | |
| 小石川 本郷 | 文京 | 戸塚・高田・巣鴨・巣鴨町・滝野川・日暮里 | |
| 下谷 浅草 | 台東 | 日暮里・南千住 | |
| 本所 | 墨田区一部 | 寺島・吾嬬・亀戸 | |
| 深川 | 江東区一部 | 砂・大島・亀戸 | |
| 京都 | 上京 | 上京区・左京区一部・中京区一部 | 白川・田中・下鴨・鞍馬口・大宮・衣笠・朱雀野・山科 |
| 下京 | 東山区一部・中京区一部・下京区一部 | 山科・深草・大内・柳原町・朱雀野 | |
| 大阪 | 北 | 北区一部・福島区一部・都島区一部・此花区一部 | 川南・川北・下福島・上福島・曽根崎・北野・川崎・都島・野田・鯰江・北新開荘 |
| 東 | 中央区 | 北新開荘・中本・玉造町 | |
| 西 | 西区一部 | 難波・三軒家・九条・川南 | |
| 南 | 中央区一部・浪速区一部 | 清堀・東平野町・西高津・天王寺・今宮・難波 |
三都以外には、一つずつ設置された
| 隣接村1889 | 備考 | |
| 札幌 | 当初未設置 後に琴似・篠路・札幌・豊平・白石・藻岩 | |
| 函館 | 当初未設置 後に亀田・湯川 | |
| 仙台 | 原町・北七田・茂ヶ崎 | |
| 横浜 | 神奈川町・戸太・中村・根岸・本牧 | |
| 新潟 | 沼垂町・輪井坂・鳥屋野 | |
| 金沢 | 戸坂・弓取・中口・小金・金村・崎浦・野村・富樫・三馬・米丸 | |
| 名古屋 | 清水町・杉村・六郷・千種・御器所・古沢・八幡・筏瀬・那古野・金城 | |
| 伏見 | 深草・堀内・向島・横大路・下鳥羽・竹田 | 1881年、区から外れた |
| 堺 | 三宝・舳松・向井・湊 | |
| 神戸 | 都賀野・山田・湊・林田 | |
| 和歌山 | 楠見・中之島・宮・宮前・岡町・雑賀・湊・野崎 | |
| 岡山 | 宇野・三櫂・古鹿田・鹿田・石井・伊島・御野 | |
| 広島 | 仁保島・府中・矢賀・中山・牛田・三篠・己斐・古田・草津・井口 | |
| 赤間関 | 長府・豊東下・彦島 | |
| 福岡 | 豊平・千代・住吉・警固・鳥飼・西新町 | |
| 長崎 | 上長崎・浦上山里・淵・下長崎・戸町 | |
| 熊本 | 大江・黒髪・清水・池田・花園・島崎・横手・春日・本山・本庄 |