代数は南朝
| 立地 | 代数 | 備考 |
| 奈良県橿原市～明日香村 （南エリア） | １～４，８，２８，２９，４０～４２ | ４０代天武天皇 |
| 奈良県御所市～高取町 （南西エリア） | ５，６，３５（３７） | |
| 奈良県王子町～香芝市 （西エリア） | ７，２３，２５ | |
| 奈良県奈良市周辺 （北エリア） | ９，１１，１３，２０，４３～４６（４８），４９ | ４３代元明天皇以降奈良時代 |
| 奈良県天理市 （東エリア） | １０，１２ | |
| 大阪府藤井寺市・羽曳野市・ （大阪府東エリア） | １４，１５，１９，２１，２２，２４，２７ | |
| 大阪府堺市 （大阪府西エリア） | １６，１７，１８ | |
| 大阪府茨木市 （大阪府北エリア） | ２６ | 遠戚から皇位継承した継体天皇 |
| 大阪府太子町 （大阪府東エリア） | ３０，３１，３３，３６ | ３３代推古天皇 |
| 奈良県桜井市 （南東エリア） | ３２，３４ | |
| 京都市山科区 | ３８ | 天智天皇 |
| 京都市伏見区桃山周辺 | ５０，北２，北３，１２２ | 桓武天皇 明治天皇 |
| 京都市右京区嵯峨～宇多野周辺 （北西エリア） | ５２，５５，５６，５８，６２，６４，６６，６９～７１，７３，８８，９０，９１，９８（南３），９９（南４） | 平安時代 鎌倉時代 |
| 京都市西京区大原野 （南西エリア） | ５３ | 平安時代 |
| 京都市伏見区深草周辺 | ５４，８５，８９，９２，９３，北４，北５，１００（北６），１０１，１０３～１０７ | 平安時代 鎌倉時代 室町時代 |
| 京都市左京区吉田周辺 | ５７，６３，６８，９４ | 平安時代 鎌倉時代 |
| 京都市伏見区醍醐 | ６０，６１ | 平安時代 |
| 京都市北区衣笠周辺 | ６５，６７，７８ | 平安時代 |
| 京都市伏見区竹田周辺 | ７２，７４，７６ | 平安時代 |
| 京都市東山区（泉涌寺除く） | ７７，７９，８０，９５ | 平安時代 鎌倉時代 |
| 京都市左京区大原 （北東エリア） | ８２，８４ | 鎌倉時代 |
| 京都府長岡京市 （南西エリア） | ８３ | 鎌倉時代 |
| 京都市東山区泉涌寺 | ８６，８７，１０８～１２１ | 鎌倉時代 江戸時代 |
| 京都市右京区旧京北町 （北部エリア） | 北１，１０２ | 室町時代 |
| 東京都八王子市 | １２３,１２４ | 大正以降 |
| ↓↓追放などの例外的な事例 | ||
| 滋賀県大津市 | ３９ | 壬申の乱で敗れた弘文天皇 |
| 兵庫県南あわじ市 | ４７ | 藤原仲麻呂失脚後に島流しとなった淳仁天皇 |
| 香川県坂出市 | ７５ | 島流しとなった崇徳天皇 |
| 山口県下関市 | ８１ | 壇ノ浦の戦いで入水した安徳天皇 |
| 奈良県吉野町 | ９６（南１） | 後醍醐天皇 |
| 大阪府河内長野市 | ９７（南２） | 後村上天皇 |