陸海空の管轄はその特性に合わせて細かく分かれている
| 地域 | 陸上 | 空自 | 海自 |
| 北海道北部 | 北部方面第2師団 | 北空エリア | 大湊 |
| 北海道東部 | 北部方面第5旅団 | 北空エリア | 大湊 |
| 北海道南部 | 北部方面第7師団 | 北空エリア | 大湊 |
| 北海道西部 | 北部方面第11旅団 | 北空エリア 千歳基地 | 大湊 |
| 青森 | 東北方面第9師団 | 北空エリア 三沢基地 | 大湊基地 |
| 岩手 | 東北方面第9師団 | 北空エリア | 横須賀 |
| 秋田 | 東北方面第9師団 | 北空エリア | 舞鶴 |
| 宮城・福島 | 東北方面第6師団 | 中空エリア 松島基地 | 横須賀 |
| 山形 | 東北方面第6師団 | 中空エリア | 舞鶴 |
| 長野・群馬・栃木 | 東部方面第12旅団 | 中空エリア | 横須賀 |
| 新潟 | 東部方面第12旅団 | 中空エリア | 舞鶴 |
| 1都3県・茨城・山梨・静岡 | 東部方面第1師団 | 中空エリア 浜松基地 静浜基地 | 横須賀基地 |
| 北陸3県 | 中部方面第10師団 | 中空エリア 小松基地 | 舞鶴 |
| 東海3県 | 中部方面第10師団 | 中空エリア 岐阜基地 小牧基地 | 横須賀 |
| 京都 | 中部方面第3師団 | 中空エリア | 舞鶴基地 |
| 播磨・摂津 大阪・奈良・和歌山 | 中部方面第3師団 | 中空エリア 奈良基地 | 呉 |
| 山陰 | 中部方面第13旅団 | 西空エリア 美保基地 | 舞鶴 |
| 山口（周防） 広島・岡山 | 中部方面第13旅団 | 西空エリア 防府北・南基地 | 呉基地 |
| 山口（長門） | 中部方面第13旅団 | 西空エリア | 佐世保 |
| 四国 | 中部方面第14旅団 | 西空エリア | 呉 |
| 福岡・長崎・佐賀 | 西部方面第4師団 | 西空エリア 春日基地 築城基地 芦屋基地 | 佐世保基地 |
| 大分 | 西部方面第4師団 | 西空エリア | 呉 |
| 宮崎 | 西部方面第8師団 | 西空エリア 新田原基地 | 呉 |
| 熊本・鹿児島 | 西部方面第8師団 | 西空エリア | 佐世保 |
| 沖縄 | 西部方面第15師団 | 南西空エリア 那覇基地 | 佐世保 |